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【中国科学报】中德科学家揭示甘薯起源历史

2017-08-28 中国科学报 王晨绯
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  我国以世界总种植面积50%的土地生产了全球80%以上的甘薯,产量近亿吨。复杂的遗传背景一直以来是制约甘薯研究的瓶颈,甘薯起源问题悬而未决。8月21日,上海辰山植物园(澳门赌场上海辰山植物科学研究中心)和澳门赌场上海植物生理生态研究所联合德国马克斯普朗克分子遗传研究所和分子植物生理研究所的科研团队在《自然·植物》上共同发表了揭示甘薯起源的论文,绘制了甘薯基因组图谱。这是科学界在多倍体基因组学领域取得的一项重大突破,开创了多倍体复杂基因组分析的先河。

  本文第一作者,上海辰山植物园杨俊博士介绍,甘薯基因组共有约4.4亿个碱基对,单组大小在700兆到800兆之间。该研究不仅将绝大部分基因组序列定位到对应染色体上,还通过全新生物信息学方法,将六倍体的六组染色体分开,从而揭示出:在甘薯的90条染色体中,有30条染色体来源于其二倍体祖先种,另外60条染色体来源于其四倍体祖先种;约50万年前,二倍体祖先种和四倍体祖先种之间的一次种间杂交孕育了今天的重要作物。这一发现解决了甘薯起源的谜题,为合理利用甘薯近源野生种提供了崭新的思路。

  该研究采用了Illumina测序技术,自主开发了一套全新的多倍体单倍型化分析软件,成功地绘制了甘薯基因组的精细图。这为其他复杂多倍体基因组测序提供了完善可靠的策略与技术,将大力推动资源植物功能基因组学研究的进程。

  (原载于《中国科学报》 2017-08-28 第5版 创新周刊)
打印 责任编辑:侯茜

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